Il va faire des recherche et ressort les plans de la Prison de Fox River, plan sur lesquels il a lui même travailler pour sa construction.
Il décide alors de se faire un tatouage, qui ne ressemble et ne veut pas dire grand-chose, mais qui pourtant est leur clé de sorti et va ensuite braquer une banque pour pouvoir se faire incarcérer à son tour.
Le jour de son procès, il est défendu par une avocate et amie des 2 frères, Veronica Donovan (Robin Tunney) et tout cela sous les yeux de son neveu et fils de Lincoln, Lincoln Burrows Junior "alias L.J." (Marshall Allaman) qui lui ne parle plus à son père et vit avec sa mère.
Michael va alors faire comprendre à Veronica qu'il va en prison pour faire sortir son frère et qu'il a un plan.
Veronica va peu à peu croire en la thèse de complot et va, quant à elle, faire des recherche pour innocenter Lincoln de son côté.
Elle va s'adresser à un cabinet d'avocats qui défendent les détenus innocent, elle fera la rencontre d'un certain Nick qui va l'aider dans ses perilleuses recherches dangereuses et mêmes parfois mortelles.
Dans la prison Michael essai tant bien que mal de sortir son frère et lui éviter la chaise éléctrique, mais il est souvent freiner par les détenus, parfois sympa comme Fernando Sucre (Amaury Nolasco), Charles Westmorland (Muse Watson) et parfois méchants et psycho comme John Abruzzi (Peter Stormare), Theodore Bagwell "alias T-Bag" (Robert Knepper).
La tâche de Michael Scoffield ne sera pas de tout repos.
A prouver son innocence ?




